Les cèpes poussent principalement dans les forêts sur des sols acides à neutres. Ils ont une relation symbiotique avec certains arbres hôtes et se trouvent souvent sous des feuillus comme les chênes, châtaigniers, hêtres, charmes, mais aussi parfois sous des conifères comme les pins, les sapins et les épicéas. Ils aiment les sols bien drainés, les bois bien débroussaillés laissant passer la lumière, et se développent souvent à l'orée des bois, dans les clairières, ou en bord de chemins. L'altitude peut varier selon l'espèce, généralement jusqu'à 700 m pour certains cèpes et jusqu'à 2000 m pour d'autres. La pousse des cèpes est favorisée par un climat humide et doux, spécialement après des pluies abondantes en fin d'été et début d'automne. Voici un détail des habitats par type de cèpe :
- Cèpe d'été : sols neutres à acides, sous châtaigniers, chênes et hêtres, pas au-dessus de 700 m.
- Cèpe bronzé : sols neutres à acides, sous châtaigniers, chênes sessiles et pubescents, à basse altitude.
- Cèpe des pins : sols acides, sous conifères (pins, épicéas, sapins), altitude jusqu'à 2000 m, aime les milieux frais et humides.
- Cèpe de Bordeaux : sols acides, sous hêtres, chênes, châtaigniers, épicéas, sapins et pins, altitude jusqu'à 2000 m, préfère les milieux frais et humides.
Ils poussent généralement entre mai et octobre, avec une préférence pour septembre et octobre, après des chocs thermiques et des pluies importantes. Ainsi, pour trouver des cèpes, il faut chercher dans des forêts mixtes ou diversifiées avec ces arbres, sur des sols bien drainés, souvent au bord des bois ou dans des clairières, avec un climat humide favorable.