عدد ولايات محافظة ظفار هو عشر ولايات. وهذه الولايات هي: صلالة، طاقة، مرباط، سدح، شليم وجزر الحلانيات، رخيوت، ثمريت، ضلكوت، المزيونة، ومقشن. مركز المحافظة هو ولاية صلالة.